Поскольку надо различать пейринги канонные и фэндомные, сразу оговорюсь, что в каноне пейрингов пока нет. У одного фэндомного пейринга есть хороший потенциал стать канонным, если мангака решит добавить в сюжет немного романтики. И есть еще один пейринг — тот самый, который мне активно не нравится и которого, естественно, нет и не будет, но на который есть недвусмысленные намеки.

Что касается немногочисленного фэндома, то популярнее всего в нем как раз остальные пейринги.
1. Мидори/Юкимура. Тут все понятно: садист и мазохист — идеальная пара. Была бы, если бы Юкимура был мазохистом. И если бы они испытывали друг к другу не только отрицательные эмоции.
2. Мидори/Фудзимон. Тут все понятно: садист и мазохист — идеальная пара. Была бы, если бы Мидори относился к Фудзимону как к партнеру, а не как к домашнему питомцу.
3. Масамунэ/Юкимура. Тут все понятно: лучшие друзья, для Юкимуры на Масамунэ свет клином сошелся, у Масамунэ пунктик на том, что его все бросают. Все могло бы быть, если бы Масамунэ проявил хотя бы минимальный интерес. Но Масамунэ (как и Юкимура), во-первых, натурал, во-вторых, если кто из мужчин и мог бы его заинтересовать в сексуальном плане, то отнюдь не Юкимура.


Для тех, кто не в курсе: (слева направо) Юкимура, Масамунэ, Хотару, Фудзимон, Мидори, Акабанэ.

Кроме того, есть еще пара обнадеживающих эпизодов для любителей юри, а кроме того, есть в аниме и другие персонажи (а в манге-то, в манге еще двое добавляется к основному составу!), так что комбинаций хватает. Но если вспомнить мою сказочную теорию, то реально возможен — и, наверное, пока это самый правильный вариант — только пейринг Хотару/Масамунэ. У нас есть принцесса Масамунэ, которую нужно спасти. Спасти принцессу может только принц. Вернее, тот, кто спасет принцессу, и станет нашим принцем. Юкимура спасти принцессу не может. Он сам это понимает и прямым текстом просит Хотару: "Спаси его". Кроме того, в прошлом (да и сейчас) Масамунэ был для Юкимуры принцем — тем, кто спасает. Но Юкимура не принцесса. Он рыцарь. А вот Хотару — самый настоящий сказочный принц. Такая вот неправильная сказка получается. Вернее, неправильной она была бы в жанре сёдзё. Но у нас-то сёнэн.